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背景:裸子植物占种子植物六个谱系中的五个。然而,大多数已测序的植物线粒体基因组(线粒体基因组)都是针对被子植物生成的,而仅针对六种裸子植物生成了线粒体基因组序列。特别是,除了针叶树 II(非松科针叶树或柏树门)之外,所有主要种子植物谱系都有完整的线粒体基因组,针叶树 II 是一个包括六个科的重要谱系,这阻碍了对裸子植物线粒体基因组多样性和进化的全面了解。结果:在这里,我们报告了针叶树 II 中东北红豆杉的完整线粒体基因组。与之前发布的裸子植物线粒体基因组相比,我们发现红豆杉和千岁兰的线粒体基因组各自丢失了许多基因,而苏铁、银杏和松科的线粒体基因组中所有基因都得到了鉴定。裸子植物的一些谱系中也丢失了多个 tRNA 基因和内含子,与被子植物中观察到的模式相似。一般来说,裸子植物中的基因簇可能比被子植物中的保守性更低。此外,在红豆杉和千岁兰线粒体基因组中发现的 RNA 编辑位点比其他线粒体基因组中少,这可能与这两个物种中内含子较少和基因频繁丢失有关。

东北红豆杉 (Taxus cuspidata) 的完整线粒体基因组 (...

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