抽象神经元通过包装到突触囊泡(SVS)中的小分子神经递质的活动依赖性释放来传达。尽管许多分子已被鉴定为神经递质,但技术局限性排除了对SV含量的完整代谢组学分析。在这里,我们提出了一个快速分离SV的工作流程,并使用质谱法以高分辨率询问其代谢含量。我们使用靶向极性代谢组学验证了原代皮质神经元中谷氨酸的富集。从这些神经元中分离出的SV的无偏和广泛的全球分析表明,它们唯一可以检测到的极性代谢物是已建立的神经递质谷氨酸和GABA。此外,我们采用了直接从脑组织中快速捕获SV的方法,并以细胞类型的特异性方式确定了不同脑区域的神经递质谱。询问SV内容的方法的速度,鲁棒性和精度将促进对神经传递的化学基础的新见解。