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basidiomycota是真菌的大型且多样的门。它们可以制造生物活性代谢产物，或者启发了抗生素和农业化学物质的合成。萜类化合物是该分类单元中遇到的最丰富的天然产品类别。已经描述了其他天然产物类别，包括聚酮化合物，肽和吲哚生物碱。基本菌真菌对天然产物的发现和研究已被妨碍了杂物因子，其中包括其缓慢的生长和复杂的基因组结构。基因组和代谢组研究工具的最新发展使研究人员可以更轻松地处理基本菌真菌的次级代谢组。廉价的长读全基因组测序可以使高质量的基因组组装，从而改善了可以预测天然产物基因簇的支架。基于CRISPR/CAS9的基于基础菌进行真菌的工程已被描述，并将在将天然产品与其遗传决定因素联系起来中起重要作用。已经开发了基因瘤基因和基因簇异源表达的平台，从而实现了自然产物生物合成研究。分子网络分析和公开可用的天然产品数据库有助于数据消除和自然产品表征。这些技术进步的结合促使人们从基质菌真菌发现自然产品发现的兴趣恢复了兴趣。
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