引入基因表达模式的分析是许多现代生物学研究项目的常见和重要组成部分。这种分析可以提供有关基因表达模式如何驱动细胞命运和功能的见解,以及突变,药物,疾病,生理刺激和压力如何影响基因表达程序。基因表达模式的第一级分析是量化基因转录的水平。这种“转录组”分析通常涉及确定哪些RNA是某些细胞,组织或发育阶段的特征。这需要在这些样品中获得RNA的高信心列表。研究人员面临决定如何介绍RNA群体的挑战,将其RNA曲线与已经发布的曲线进行比较,并确定哪些转录本是特定细胞,组织,阶段,阶段,突变体或干预措施的特征。该底漆 - 用于新的转录组分析的概述 - 描述了广泛使用的方法来隔离细胞和组织,并准备了用于转录物分析的样品,并讨论了处理RNA序列(RNA-SEEQ)数据(RNA-SEQ)数据(RNA-SEQ)数据的考虑因素,并生成了基因或“基因或“基因集”的列表,该列表中表达了特定细胞类型。我们使用线虫秀丽隐杆线虫中的例子,但强调教训和考虑范围跨系统扩展。在过去几年中,单细胞RNA-Seq变得越来越流行。由于处理和分析此类数据涉及许多独特的考虑,并且在其他地方进行了审查,因此我们不会深入研究单细胞RNA-Seq,而是将读者推荐给读者,以获取有关此主题的评论以获取更多细节(Hwang等,2018; Luecken and Theis,2019)。
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