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噬菌体是微生物群落动态,功能和进化的关键生态驱动因素之一。尽管它们在细菌生态学和进化过程中的重要性,但噬菌体基因的特征很差,阻碍了它们在各种生物技术应用中的用法。表征此类基因的方法,即使是对噬菌体生命周期至关重要的基因,也是劳动密集型的,通常是噬菌体的。在这里,我们开发了一种可扩展到可扩展到新的噬菌体 - 宿主组合的系统基因质量映射方法,该方法促进了非必需基因的鉴定。作为概念证明,我们使用阵列的基因组宽CRISPR干扰(CRISPRI)分析来映射基因coliphagesλ和p1中的基因本质景观。是由一系列CRISPRI探针导致的,这在很大程度上是根据lambda的数十年遗传分析确定的基本基因花名册,并为P1中必不可少的和非必要的基因座提供了新的见解。我们提供了CRISPRI极性如何导致假阳性基因的必要性分配的证据,并建议对解释CRISPRI的基因本质数据的谨慎态度。最后,我们表明我们可以通过将DNA条形码插入新确定的内部区域来设计噬菌体,这将增强各种应用中噬菌体的识别,量化和跟踪过程的能力。

全基因组的系统绘制映射,以识别噬菌体中的非必需基因

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