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批量RNA-seq教学手册本手册的目的是为蒙大拿州立大学研究人员提供实用指南，以执行散装RNA-Seq。作者：蒙大拿州立大学的微生物学和细胞生物学系Dana Rashid为本手册提供了资金，由NSF EPSCOR Grant＃2229308提供。I.简介页＃什么是散装RNA-Seq？2可以用散装RNA-seq研究什么？2限制3个散装RNA-seq与PCR阵列3个散装RNA-SEQ与单细胞RNA-Seq 3转录组覆盖范围，具有不同的Illumina平台4 II。样品制备和cDNA库的生产数量的每个样品4初始样品制备5-6评估RNA产量和质量6-7 mRNA富集与rRNA耗竭7的产生cDNA库7-8 cDNA库库测序8-10 III。生物信息学原始测序数据处理10参考库对齐10块RNA-seq数据分析10-主成分分析10-11差分基因表达分析11-13 MSU内部程序，并与外部设施14 IV接口。设备和供应设备和供应设备用于细胞分类14的RNA提取15用于测序15计算机要求15的cDNA库15所需的RNA隔离供应15用于cDNA生产15 V.联系信息16 VI。协议协议＃1。从鸡盘软骨中隔离的RNA 17-18方案＃2。从斑马鱼胚胎19-20 VII中分离出RNA。 参考21从斑马鱼胚胎19-20 VII中分离出RNA。参考21
散装RNA-seq教学手册
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