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摘要 Ð CRISPR 介导的基因调控因其可扩展性而备受关注,可以创建越来越大的遗传回路。由于不同小向导 RNA 之间对 dCas9 资源的竞争而产生的非预期相互作用已被广泛描述为 CRISPR 介导的抑制 (CRISPRi)。对于 CRISPR 介导的激活 (CRISPRa),这种分析在很大程度上是缺失的。在本文中,我们考虑两个必需的共享资源 (dCas9 和激活蛋白) 对 CRISPRa 进行建模,并确定通过资源竞争出现的相互作用图。多个支架 RNA (scRNA) 之间存在两个共享资源是造成两种主要现象的原因。首先,我们用数学证明了“自我隔离”效应的存在,其中 scRNA 抑制其自身的靶基因而不是激活它,从而否定了 CRISPRa 的功能。其次,我们证明与单一资源的情况相比,非靶基因的不必要抑制要强得多。这些结果表明,同时调节多种资源的新控制方法将有助于减轻 CRISPRa 中资源竞争的不良影响。

CRISPR 介导的基因激活回路中由于资源竞争而产生的相互作用*

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