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弗里德赖希共济失调是一种无法治愈的疾病,由 frataxin (FXN) 蛋白缺乏引起,主要由 FXN 基因内含子 1 中的 GAA 重复扩增引起。在这里,我们鉴定了与 FXN 前 mRNA 第一个内含子内的两个区域互补的反义寡核苷酸 (ASO),它可以使患者成纤维细胞中的 FXN mRNA 增加约 2 倍。通过在每个区域鉴定多个重叠的 FXN 激活 ASO、两个独立的 RNA 定量分析和多个管家基因的标准化,证实了 FXN mRNA 的增加。对删除 ASO 结合位点的细胞进行的实验表明,ASO 诱导的 FXN 激活是由间接效应驱动的。 RNA 测序分析表明,两种 ASO 诱导了相似的转录组范围变化,与野生型细胞的转录组不同。这种 RNA 测序分析未识别出 ASO 之间共有的直接碱基配对脱靶基因。错配研究确定了 ASO 中 FXN 激活所需的两个富含鸟苷酸的基序 (CCGG 和 G 4 )。我们的 ASO 的磷二酰胺吗啉寡聚体类似物不会激活 FXN,这表明存在 PS 骨架介导的效应。我们的研究表明,在采用基因激活等新机制的寡核苷酸研究中,多个详细的对照实验和靶标验证非常重要。

FXN 通过间接效应表达

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