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在过去十年中，基因组编辑和多能干细胞 (PSC) 培养方面的进步使研究人员能够生成经过编辑的 PSC 系，以研究各种生物学问题。然而，在 PSC 培养过程中或由于不希望的编辑结果，细胞系中可能会出现异常。这些异常可能包括非整倍体、靶上和脱靶编辑错误以及微生物污染。任何这些异常都可能导致实验无效，因此检测它们至关重要。下一代测序价格的持续下降使全基因组测序 (WGS) 成为一种有效的质量控制选项，因为 WGS 可以检测到任何涉及 DNA 序列变化或不需要的序列存在的异常。然而，到目前为止，这种方法一直缺乏易于使用的数据分析软件。在这里，我们介绍了 SeqVerify，这是一种计算流程，旨在获取原始 WGS 数据和预期编辑列表，并验证编辑是否存在并且没有异常。我们预计 SeqVerify 将成为研究人员生成编辑 PSC 的有用工具，更广泛地说，也可用于一般的细胞系质量控制。
SeqVerify：全基因组测序数据的质量保证流程
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