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摘要 :大多数抗菌肽 (AMP) 和抗癌肽 (ACP) 折叠成膜破坏性阳离子两亲性 α 螺旋,但其中许多也具有不可预测的溶血性和毒性。在这里,我们利用循环神经网络 (RNN) 区分活性与非活性、非溶血与溶血 AMP 和 ACP 的能力,以发现新的非溶血性 ACP。我们的发现流程包括:1) 使用生成 RNN 或遗传算法生成序列,2) RNN 分类活性和溶血,3) 选择序列新颖性、螺旋性和两亲性,以及 4) 合成和测试。对 33 种肽的实验评估产生了 11 种活性 ACP,其中 4 种不溶血,其特性类似于天然 ACP lasioglossin III。这些实验展示了机器学习直接指导发现非溶血性 ACP 的第一个例子。

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