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结构变异(SV)是重大的基因组改变,在包括癌症在内的遗传多样性,进化和各种疾病中起着至关重要的作用。检测SVS的传统方法通常在计算效率,准确性和可扩展性方面面临挑战,尤其是在处理大型基因组数据时。近年来,图形处理单元(GPU)和机器学习(ML)的出现已经开发了解决这些挑战的新途径。本文探讨了GPU加速度和ML技术的整合,以增强结构变体的检测和分析。我们提出了一个全面的框架,该框架利用深度学习模型(用于在GPU上并行处理)以高精度实现实时SV检测。我们的方法不仅减轻了计算负担,而且还提高了与常规方法相比,SV检测的敏感性和特异性。通过在各种基因组数据集上进行广泛的基准测试,我们在速度,准确性和可扩展性方面证明了我们的GPU加速ML框架的出色性能。这些发现强调了将GPU和ML技术相结合以革新基因组研究的潜力,并为在临床和研究环境中更有效,更精确的结构变体分析铺平道路。

通过GPU和机器学习加速结构变体检测

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