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RNA丰度定量已成为常规和可行的，这要归功于高通量的“短阅读”技术，这些技术在基因水平上提供了准确的分子计数。对确定的全长的准确量化，转录本同工型仍然是一个固执的挑战，尽管在广泛的问题中具有明显的生物学意义。“长阅读”测序平台现在产生的数据类型，原则上可以驱动常规的确定形式量化。然而，当代长读数据型的一些细节以及同工型复杂性和遗传变异，当前的生物信息学挑战。我们在这里使用ONT数据显示，可以快速准确地量化长阅读数据，并且可以通过外部限制来改进。进行量化，我们开发了LR-Kallisto，它适应了长阅读技术的Kallisto散装和单细胞RNA-SEQ量化方法。
用LR- ...
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