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可用性和实现:Lovis4U在Python3中实现,并在Linux和MacOS上运行。命令行接口涵盖了最实际的用例,而提供的Python API允许在Python程序中使用,集成到外部工具中以及其他自定义。源代码可在github页面上获得:github.com/art- egorov/lovis4u。详细的文档,其中包括示例驱动指南,可以从软件主页上获得:art-egorov.github.io/lovis4u。简介微生物基因组数据库的指数增长已解锁了许多比较基因组分析的机会(1)。各种任务,例如对基因邻域保护的分析(2,3),功能短ORF(4,5)的注释以及基因组变异性热点(6-8)的研究通常需要可视化多个基因组基因局基因局基因局基因局基因局基因局。为此目的开发了几种软件工具。这些子集具有图形用户界面(GUI),例如Artemis比较工具(9),EasyFig(10),Genespy(11)和Geneious Prime(Geneious.com)。另一个类别包括基于Web的应用程序,例如基因图形(12)。此外,还有库,例如r套件genoplotr(13)和gggenes(14),以及python包装Genomediagram(15)。一些工具集成了多种方法,创建混合解决方案。例如,GenView是一种与交互式Web应用程序(16)相结合的Python管道(16),Clinker&ClusterMap.js(17)是一种流行的工具,具有命令行界面和可以生成矢量图形的交互式Web应用程序。尽管这些工具中的许多工具都通过GUIS或Web应用程序具有交互性,但缺乏适用用户友好的命令行工具

lovis4u:比较基因组学的基因座可视化工具

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