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Leveraging the vulnerability of pleural mesothelioma to impaired protein folding homeostasis Principal Supervisor's name : Prof Stefan Marciniak Principal Supervisor's email address: sjm20@cam.ac.uk CRUK CC Research theme: Thoracic Cancer Programme Department for student registration: CIMR / Medicine Department or institute where research will take place: CIMR / Medicine Co-supervisor's name: Robert C Rintoul Co-Supervisor教授的电子邮件：Robert.rintoul@nhs.net研究生方案：临床研究培训研究员（3年博士学位）博士学位项目大纲：胸膜间皮瘤是一种快速渐进的无效癌症，具有有限的治疗方法，具有有限的治疗方法（Obacz et al。，2021; 2021; 2021; Shamseddin et al。）。这是一种富基质的恶性肿瘤，其中肿瘤微环境的恶性细胞和细胞都积极分泌大量蛋白质，包括细胞外基质和炎症介质。缺乏有效的疾病模型导致我们组装了21种原发性间皮瘤线，并产生20种新型胸膜间皮瘤的器官。使用整个基因组CRISPR-CAS9依赖性筛选和高吞吐药筛查，我们发现蛋白质折叠稳态（蛋白质稳定）是胸膜间皮瘤的关键脆弱性。与许多其他测试的癌症模型不同，扰动的蛋白质症优先损害间皮瘤细胞和器官生长。我们30多名患者的单细胞和单核RNA测序数据提供了有关间皮瘤肿瘤所有成分的转录信息，并且允许与健康和发炎的良性胸膜组织进行比较（Obacz等，2024）。aim-3：验证间皮瘤细胞和类器官模型中鉴定的靶标。该博士学位的目的是识别和验证利用胸膜间皮瘤脆弱性到缺陷蛋白质稳态的脆弱性的治疗靶标（Clarke等，2014； Marciniak等，2021）。这将在三个目标中实现：AIM-1：挖掘我们现有的多摩变数据集（整个基因组，RNA测序，高吞吐药物筛选，整个基因组CRISPR-CAS9依赖关系筛查），以识别可行的治疗性靶标。aim-2：对恶性间皮瘤和良性石棉暴露对照进行空间转录组分析，以在患者样品中定义细胞水平上蛋白质静态途径的活性。PHD实验计划：候选人将使用我们现有的胸膜间皮瘤的多摩管数据集，包括整个基因组测序，RNA测序，整个基因组CRISPR-CAS9筛选和高吞吐药物筛选，以识别和优先确定关键的分子途径，这些途径负责负责Pleural Mesotherioma的脆弱性毛衣毛皮瘤的脆弱性。单细胞和单核RNA测序数据的胸皮瘤肿瘤和
临床研究培训研究员博士项目2025
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