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摘要：传统的抗病毒肽（AVP）发现是一个耗时且昂贵的过程。这项研究介绍了AVP-GPT，这是一种新型的深度学习方法，利用基于变压器的语言模型和专门为AVP设计设计的多模式体系结构。AVP-GPT表现出非凡的效率，在GPU系统上产生了10,000个独特的肽，并在两天内识别潜在的AVP。在呼吸道合胞病毒（RSV）数据集（AVP-GPT）中预先训练，成功地适应了流感病毒（INFVA）和其他呼吸道病毒。与LSTM和SVM等最新模型相比，AVP-GPT的困惑性显着降低（2.09 vs. 16.13）和较高的AUC（0.90 vs. 0.82），表明肽序列序列预测和AVP分类。AVP-GPT产生了一套具有出色新颖性的肽，并确定了抗病毒成功率明显高于常规设计方法的候选者。值得注意的是，AVP-GPT对RSV和INFVA产生了新的肽，具有出色的效力，其中包括四种肽，其EC50值在0.02 um左右，这是迄今为止报告的最强的抗RSV活性。这些发现突出了AVP-GPT彻底改变AVP发现和开发的潜力，从而加速了新型抗病毒药。未来的研究可以探索AVP-GPT在其他病毒靶标上的应用，并研究替代AVP设计策略。
抗病毒肽产生预训练的变压器
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