细菌精氨酸脱节酶系统(ADS)的抽象精氨酸分解代谢具有通过氨的生产来调节口腔环境的pH值。鉴于ADS途径的潜在保护能力,通过预或益生菌应用对ADS功能的口服微生物的开发是防止牙齿衰减的有前途的治疗靶标。迄今为止,大多数对口腔中的广告及其与龋齿的关系的研究集中在间接的活动或特定细菌群上,但是在口腔健康和疾病的多种混合微生物社区中,ADS操纵子的普遍性和表达率仍然是一个悬而未决的问题。在这里,我们使用多元方法,将超深的元文字测序与配对的metataxonomic和体外柑橘丁物定量相结合,以表征微生物群落和ADS操纵子在健康和晚期洞穴中的表达。虽然健康牙齿的ADS活性较高,但我们鉴定了多个细菌谱系,在熟牙上具有上调ADS活性的多个细菌谱系,这些谱系与使用基于参考的映射和从头组装方法的健康牙齿上的牙齿不同。我们的双重metataxonomic和metatranscriptomic方法证明了物种丰度对基因表达数据解释的重要性,并且差异表达的模式可以被低含量的群体偏斜。最后,我们确定了物种内的几种潜在候选益生菌细菌谱系,这些谱系可能是预防牙齿衰减的有用治疗靶标,并提出,鉴于此处确定的整个健康组所识别的分类群的异质性,鉴于菌株特异性,混合菌益生菌的发展可能是一种有益的方法。
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