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Title: Specificity, synergy, and mechanisms of splice-modifying drugs Authors : Yuma Ishigami 1,† , Mandy S. Wong 1,2,† , Carlos Martí-Gómez 1 , Andalus Ayaz 1 , Mahdi Kooshkbaghi 1 , Sonya Hanson 3 , David M. McCandlish 1 , Adrian R. Krainer 1,* , Justin B. Kinney 1,*。隶属关系:1。Cold Spring Harbour实验室,纽约州冷泉港,美国11724,美国。2。当前地址:横梁治疗学,马萨诸塞州剑桥,美国02142,美国。3。flatiron Institute,纽约,纽约,10010,美国。†同等贡献。*通信:krainer@cshl.edu(ark),jkinney@cshl.edu(jbk)。摘要:针对MRNA剪接的药物具有很大的治疗潜力,但是对这些药物的工作原理的定量了解受到限制。在这里,我们引入了机械解释的定量模型,以针对剪接修改药物的序列特异性和浓度依赖性行为。使用大量平行的剪接测定,RNA-seq实验和精确剂量反应曲线,我们获得了两种用于治疗脊柱肌萎缩的两种小分子药物Risdiplam和Branaplam的定量模型。的结果定量地表征了Risdiplam和Branaplam对于5'剪接位点序列的特异性,这表明Branaplam通过两种不同的相互作用模式识别5'剪接位点,并证明了SMN2 Exon 7的Risdiplam活性的普遍的两点假设。结果还表明,在小分子药物和反义寡核苷酸药物中,异常的单药合作以及多药协同作用是促进外生包容的。Nusinersen 11–我们的定量模型阐明了现有治疗的机制,并为新疗法的合理发展提供了基础。引言替代性mRNA剪接已成为药物发育的主要重点1-10。已经开发了三种剪接改良药物 - Nusinersen,Risdiplam和Branaplam,以治疗脊柱肌肉萎缩(尽管Branaplam已撤回)。所有三种药物都通过促进SMN2外显子7。

特异性,协同性和剪接修改药物的机制

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