抽象的微生物在各种多孔环境中（从土壤和河床再到人类肺部和癌症组织）繁衍生息，涵盖了多个尺度和条件。局部因素的短期到长期波动会诱导时空异质性，通常会导致生理压力的环境。微生物如何反应和适应这种生物物理约束是一个积极的研究领域，在过去的几十年中，已经获得了相当大的洞察力。以细菌为重点，我们在这里回顾了无机和有机多孔环境中自组织和分散的最新进展，强调了主动相互作用和反馈的作用，从而介导了微生物生存和适应性。我们讨论了使用综合方法来提高我们对微生物在各种规模上采用的生物物理策略的理解以使多孔环境可居住的开放问题和机会。