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在水生生态系统的水下是一个充满生命的微观宇宙，在维持这些环境的微妙平衡中起着至关重要的作用。水生微生物学探讨了各种水体中微生物的多样性和功能，从广阔的海洋到最小的淡水池塘。在水生环境中，最丰富，最多样化的微生物群是营养循环的关键参与者。例如，硝基瘤和硝化细菌参与硝化过程，将氨转化为氮气中的硝酸盐。一些细菌也有助于有机物的降解，在营养回收中起重要作用。从微观浮游植物到较大的宏观形式，藻类是带有光合作用的阳光的主要生产者。硅藻，鞭毛藻和绿藻是水生食物网的重要贡献者，通过生产有机化合物为各种生物提供了能量。这些单细胞真核生物是水生生态系统中重要的消费者。鞭毛，纤毛和变形虫在调节细菌种群，回收养分以及作为较高营养水平的食物方面起着作用。病毒虽然不是严格归类为生物体，但在水生环境中很丰富，并影响微生物种群。噬菌体，感染细菌的病毒可以调节细菌群落，影响养分循环和微生物多样性。水生微生物对于包括碳，氮和磷循环在内的营养循环过程至关重要。细菌和藻类有助于释放有机物的细分，从而释放出其他生物可以利用的营养。藻类和蓝细菌进行光合作用，将阳光转化为化学能。这个过程不仅支持这些微生物的生长，而且还为其他水生的能源提供了主要的能量
水生环境中的微生物多样性
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