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抗菌素抗性对公共卫生构成了日益严重的威胁,强调了迫切需要对23种新型治疗策略的需求。抗菌肽(AMP),具有不同动作机制的短肽序列,由于其针对病原体的广谱活性,提供了一种有希望的替代方法。最近的25种蛋白质语言模型(PLM)的进展彻底改变了蛋白质结构预测和26个功能注释,突出了它们的AMP发现和治疗性发育的潜力。在这27个上下文中,我们提出了AMP隔离剂(抗微生物肽结构进化矿工),这是一个AI驱动的28框架,旨在识别元基因组组装的基因组(MAGS)中的AMP。通过将29个PLM,结构聚类和进化分析整合到框架中,AMP隔离机可以识别30个由小的开放式阅读框架(SMORF)和加密的肽(EPS)编码的30安培,显着31个扩展了发现空间。使用这种方法,我们确定了来自32个不同栖息地的1,670,600座安培候选者。对29名候选者的实验验证显示,抗菌活性在18中,13 33超过抗生素的有效性。对人类肠道微生物组的AMP的进一步分析34显示了保守和适应性进化策略,可确保其在35动态肠道环境中的功能疗效。这些发现位置放大器作为发现的强大工具36

揭示了肠道中抗菌肽的演变

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