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基因表达调节中的遗传变异对表型32变异有很大贡献。了解DNA序列和表观依恋修饰的变异如何导致33个基因表达变异仍然是一项艰巨的任务。在杂种动物的34个环境是均匀的杂种动物中，父亲和母体35等位基因的表达之间的差异必须是由于顺式序列或表观遗传差异所致。因此，混合映射是一种有效识别和表征在CIS中的37个机制下调节基因的36强方法。在这项研究中，使用表型发散的杜罗克38和Lulai Pig品种的相互交叉，我们在四个发育阶段对调节性39变化进行了全面的多摩尼克表征。迄今为止，我们在猪中生产了一个40个最大的多OMIC数据集，其中包括16个整个基因组测序基因组，41 48个48个全基因组Bisulfite测序，168个ATAC-SEQ和168个RNA-SEQ样品。我们开发了42种基于读数的新方法，以可靠地评估等位基因特异性甲基化，染色质43可访问性和RNA表达。我们表明，在所有DNA甲基化，染色质可及性和基因45表达中，组织特异性比44个发育阶段特异性强得多。我们鉴定了573个基因，显示了等位基因特异性表达，包括受父母的影响46的基因以及等位基因基因型效应。52通过整合甲基化，染色质47可访问性和基因表达数据，可以通过等位基因特异性甲基化和/或染色质访问性来解释这些等位基因特异性表达中的许多。这项研究提供了多个组织的调节变化和猪发育50个阶段的最大49个综合特征之一，并为这一重要的食物动物51种提供了新的遗传改善机会。
JAX动物行为系统（JABS）
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