背景:RNA甲基化修饰是以表观遗传学方式调节的重要后翻译后修饰。最近,n 6-甲基腺苷(M 6 A)RNA修饰已成为肿瘤生物学的潜在表观遗传标记。方法:LIHC的基因表达和临床病理数据是从癌症基因组图集(TCGA)数据库中获得的。使用PERL和R软件通过基因表达分析确定长期非编码RNA(LNCRNA)和M 6 A与M 6与A之间的关系。共表达网络,并使用单变量COX回归分析鉴定了与预后相关的相关LNCRNA。然后将这些LNCRNA分为两个簇(群集1和群集2),以确定不同LNCRNA亚型之间的存活率,病原参数和免疫细胞浸润的差异。进行了最低的绝对收缩和选择算子(Lasso)进行回归分析和预后模型。HCC患者被随机分为火车组和测试组。根据模型的中位风险评分,HCC患者分为高风险和低风险组。我们使用火车组建立了模型,并通过测试组确认了模型。使用R软件分析了肿瘤突变负担(TMB),免疫逃避和免疫功能的M 6 A-LNCRNA。AL355574.1被确定为重要的M 6 A相关LNCRNA,并选择进行进一步研究。伤口愈合和Transwell分析用于确定细胞迁移能力。最后,进行了体外实验,以确认AL355574.1对HCC生物学功能和可能的生物学机制的影响。HUH7和HEPG2细胞,通过CCK-8,EDU和菌落形成测定法测量细胞增殖能力。MMP-2,MMP-9,E-钙粘着蛋白,N-钙粘着蛋白和Akt/mTOR磷酸化的表达水平均由Western blotting确定。结果:通过一致的聚类分析将具有显着预后值的LNCRNA分为两个亚型。我们发现lncRNA亚型之间的临床特征,免疫细胞浸润和肿瘤微环境(TME)显着差异。我们的分析表明,这些不同的LNCRNA亚型与免疫浸润和基质细胞之间的显着相关性。我们使用LASSO回归创建了最终风险概况,其中特别包括三个LNCRNA(AL355574.1,AL158166.1,TMCC1-AS1)。构建了由三个LNCRNA组成的预后特征,该模型显示出出色的预后预测能力。低风险队列的总生存期(OS)显着高于火车和测试组的高风险队列。两个风险评分[危险比(HR)= 1.062; P <0.001]和阶段(HR = 1.647; P <0.001)被视为通过单变量和多元COX回归分析的HCC预后独立指标。在HUH7和HEPG2细胞中,AL355574.1敲低抑制了细胞的增殖和迁移,抑制了MMP-2,MMP-9,N-钙粘着蛋白和AKT/MTOR磷酸化的蛋白质表达水平,但促进了E-Cadherin的蛋白质表达水平。
主要关键词