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导致疾病易感性增加的衰老分子特征仍不清楚。本文我们展示了与年龄和衰老相关的人脑转录组学谱，该谱来自对 2202 个大脑样本（皮层、海马和小脑）的四组独立全基因组表达数据的系统整合分析，这些样本来自不同年龄段的个体（从 5-10 岁的婴儿到高达 100 岁的老年人），按几十年的年龄阶段分类。该研究提供了在皮层中检测到的 1148 个基因、在海马中检测到的 874 个基因和在小脑中检测到的 657 个基因的特征，根据稳健的伽马秩相关分析，这些基因随着年龄的增长表现出显著的差异表达变化。这些特征表明，皮层和海马之间有 258 个基因明显重叠，三个大脑区域之间有 63 个共同基因。功能富集分析和细胞类型分析着眼于皮质，提供了关于衰老特征的生物学见解。应激反应和免疫反应是上调功能。突触、神经传递和钙信号是下调功能。基于单细胞数据的细胞分析表明，生命早期阶段的神经元活动增加，而老年阶段的神经元活动减少。调控分析确定了与皮质和海马共有的 258 个基因特征相关的转录因子 (TF)；揭示了 MEF2(A,D)、PDX1、FOSL (1,2) 和 RFX(5,1) 作为特征候选调节因子的作用。最后，使用深度学习神经网络算法基于衰老特征构建生物年龄预测器。本文是 Federico Manuel Giorgi 博士和 Shaun Mahony 博士编辑的题为“转录谱和调控基因网络”的特刊的一部分。
基因调控机制 - 数字 CSIC
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