CRISPR 干扰(CRISPRi)和 CRISPR 激活(CRISPRa)由于其设计简单且有效,已成为控制细菌基因表达的普遍方法。通过调节目标基因的转录,CRISPRi/a 可以动态地设计细胞代谢,实现转录调控电路,或阐明从较小的靶向文库到整个基因组文库的基因型-表型关系。虽然 CRISPRi/a 主要在模型细菌大肠杆菌和枯草芽孢杆菌中建立,但越来越多的研究表明这些工具可以扩展到其他细菌物种(这里泛指非模型细菌)。在这篇小型评论中,我们讨论了导致 CRISPRi/a 工具在不同非模型细菌中创建速度较慢的挑战,并总结了这些方法在细菌门中的现状。我们发现,尽管在非模式微生物中建立新型 CRISPRi/a 存在潜在困难,但文献中已报道了 8 个细菌门类中 190 多个近期实例。大多数研究都侧重于工具开发或使用这些 CRISPRi/a 方法来探究基因功能,而将 CRISPRi/a 基因调控应用于代谢工程或高通量筛选和选择的例子较少。迄今为止,大多数 CRISPRi/a 报告都是针对非模式细菌物种的常见菌株开发的,这表明在未驯化细菌中建立这些遗传工具仍然存在障碍。更有效和更通用的方法将有助于实现基于 CRISPR 的可编程转录控制在各种细菌中的巨大潜力。