3D 染色质组织和表观遗传调控的改变推动了癌症进展。在这里,我使用胶质母细胞瘤 (GB) 作为模型来了解表观遗传变化对肿瘤生物学的广泛影响。通过绘制 GB 中的启动子-增强子相互作用组和染色质状态,我们发现染色质结构的广泛重新布线导致与突触通讯、轴突发生、轴突引导和染色质重塑相关的基因网络的激活。这些网络的核心是转录因子 (TF),例如 SMAD3 和 PITX1,它们被确定为介导神经元到胶质瘤突触通讯的基因调控网络 (GRN) 中的关键参与者。此外,我们表明,调节 TF 的活性(例如介导神经元到胶质瘤突触的 SMAD3)可以影响肿瘤生长。这些发现强调了表观遗传变化和 3D 基因组拓扑重组如何使 GB 细胞整合神经信号并将其转化为增殖反应。