尽管生物信息学、系统生物学和机器学习最近取得了进展,但准确预测药物特性仍然是一个悬而未决的问题。事实上,由于生物环境是一个复杂的系统,传统的基于化学结构知识的方法无法完全解释药物与生物靶标之间相互作用的性质。因此,在本文中,我们提出了一种无监督机器学习方法,该方法使用我们了解的有关药物-靶标相互作用的信息来推断药物特性。为此,我们根据药物-靶标相互作用定义药物相似性,并根据药物-药物相似性关系构建加权药物-药物相似性网络。使用能量模型网络布局,我们生成与特定、主要药物特性相关的药物社区。然而,这些社区中 13.59% 的药物似乎与主要药理特性不匹配。因此,我们将它们视为药物重新利用的提示。测试所有这些重新利用提示所需的资源相当可观。因此,我们引入了一种基于中介性/度节点中心性的优先级机制。通过使用介数/度作为药物再利用潜力的指标,我们确定药物甲丙氨酯可能是一种抗真菌药物。最后,我们使用基于分子对接的稳健测试程序进一步确认甲丙氨酯的再利用能力。
主要关键词