摘要 现在可以使用高通量遗传扰动筛选系统地识别癌细胞系中的遗传相互作用(包括合成致死效应)。尽管取得了这一进展,但很少有遗传相互作用在多项研究中得以重现,而且许多相互作用似乎具有高度的环境特异性。在这里,通过开发一种新的计算方法,我们确定了 220 种强大的驱动基因相关遗传相互作用,这些相互作用可以在独立实验和非重叠细胞系组中重现。对这些相互作用的分析表明:(i) 致癌基因成瘾效应比致癌基因相关的合成致死效应更强大;(ii) 强大的遗传相互作用在蛋白质产物物理相互作用的基因对中富集。利用后一种观察结果,我们使用蛋白质-蛋白质相互作用网络来识别与乘客基因改变相关的强大合成致死效应,并验证了两种新的合成致死效应。我们的结果表明,蛋白质-蛋白质相互作用网络可用于优先考虑对肿瘤异质性更具鲁棒性的治疗靶点。
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