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基于 CRISPR-Cas9 文库的高通量筛选已成为一种有吸引力且强大的技术，用于识别功能研究的靶基因。然而，由于缺乏用户友好的实用程序和涵盖第三方实验的最新资源，公共数据的可访问性受到限制。在这里，我们描述了 iCSDB，一个使用人类细胞系的 CRISPR 筛选实验的综合数据库。我们汇编了两个主要的 CRISPR-Cas9 筛选来源：DepMap 门户和 Bi- oGRID ORCS。DepMap 门户本身是一个综合数据库，其中包括三个大型 CRISPR 筛选项目。我们还从 BioGRID ORCS 汇总了 CRISPR 筛选，它是来自 PubMed 文章的筛选结果集合。目前，iCSDB 包含 976 种人类细胞系的 1375 个全基因组筛选，涵盖 28 种组织和 70 种癌症类型。重要的是，我们消除了不同 CRISPR 库的批次效应，并将筛选分数转换为单一指标以估计敲除效率。我们还整合了临床和分子信息，以帮助用户轻松选择感兴趣的细胞系。此外，我们还实施了各种交互式工具和查看器，以方便用户在基因和指导 RNA 水平上选择、检查和比较筛选结果。iCSDB 可在 https://www.kobic.re.kr/icsdb/ 上找到。
iCSDB：CRISPR 屏幕的集成数据库
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