将功能分配给基因并学习如何控制其表达是细胞生物学和治疗发育的基础的一部分。遗传筛查是一种有效且公正的方法,它在历史上需要艰苦的克隆产生和表型,并且仍然受到当今规模的限制。使用CRISPR-CAS调节基因功能并在单个细胞中测量它的快速技术进步已经重新获得了主要的实验约束,并启用了通过单个细胞的复杂读数进行汇总的筛选。在这里,我们回顾了汇总单细胞CRISPR筛查的原理和实践考虑因素。我们讨论了扰动策略,实验模型系统,与单个单元格的概述,读取细胞表型和数据分析。我们的重点是单细胞RNA测序和基于细胞分类的读取,包括启用图像的细胞分类。我们期望这种变革性的方法可以在接下来的几十年中推动生物医学研究。