人乳头瘤病毒（HPV）是宫颈癌以及头颈癌的良好危险因素。对HPV疫苗的研究需要细致的遗传分析，以查明各种（高风险）HPV基因型。同样，流行病学研究要求对普遍的HPV菌株进行全面的基因审查。在多种临床状况中，对普遍的HPV菌株进行了详细分析，例如肛门生殖器和头颈癌（包括口腔和喉癌）以及肛门，阴茎和外阴鳞状细胞癌。