背景:越来越多的证据表明,HPV感染在膀胱癌(BC)的起始和进展中起关键作用。然而,确定卑诗省HPV相关基因的预测价值仍然具有挑战性。方法:我们从TCGA和GEO数据库中鉴定出差异表达的BC患者的HPV相关基因。我们使用Cox和Lasso回归筛选了预后基因,随后建立了风险预测模型。使用Kaplan-Meier生存分析和ROC曲线测量了模型的精度和临床相关性。在高风险和低风险的集合中进行了功能富集,免疫细胞浸润和药物敏感性分析。PCR分析用于测量基因的表达水平。结果:我们为风险模型确定了13个与HPV相关的基因。在其中,将FLRT2,HOXC5,LDLR,SCD,GRM7,DSC1,EMP1和HMGA1鉴定为风险贡献者,而LPA,SERPINA6,ZNF124,ETV7和SCO2被认为是保护性的。COX回归分析验证了我们的模型在膀胱癌(BC)患者中提供了整体生存(OS)的独立预测。基因本体论(GO)分析显示,在伤口愈合,细胞外基质组成和富含胶原蛋白的细胞外基质中,主要基因富集。KEGG途径分析突出了主要的富集区域,包括焦点粘附,PI3K-AKT信号通路和ECM受体相互作用。风险评分与肿瘤微环境(TME)评分,免疫细胞浸润以及对化学疗法和免疫疗法的敏感性相关。结论:我们已经制定了一个风险评估模型,该模型指出了卑诗省的13个中央HPV相关基因。这些基因作为预后指标和治疗靶标的潜力,强调了HPV诱导的BC进展与免疫景观之间的相互交织的关系。
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