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摘要:尽管对急性呼吸道(CO)感染具有快速准确的诊断至关重要,但呼吸医学了解当前实验室方法的优势至关重要。在这项研究中,我们用可用的PCR分析测试了鼻咽样品(n = 29),并将结果与​​基于杂交捕获的MNG的结果进行了比较。阳性PCR样品的检测标准为CT <35,对于MNGS样品,目标覆盖率> 40%,中位深度为1X和RPKM>10。记录了高度的一致性(98.33%PPA和100​​%NPA)。然而,MNG在PCR以外产生了29种额外的微生物(23种细菌,4种病毒和2种真菌)。然后,我们使用IDBYDNADixplify®平台(Illumina®Inc,San Diego,CA,USA)将每种方法的微生物分为三种表型类别,以考虑感染性和下呼吸道区域的潜在。发现急性上呼吸道感染的全面但与临床相关的微生物学表现很重要,在免疫功能不佳或与合并症呼吸道疾病或传统综合症无法识别病原体的情况下,尤其重要。因此,该技术可用于补充基于当前综合征的测试,并且可以在表型中快速有效地表征数据,以表征用于传播潜力,临床(CO)感染和合并考虑 - 有望降低发病率和死亡率。

急性上呼吸道感染的菌群

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