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摘要DNA存储我们的遗传信息，并且在生物学和生物技术应用中无处不在，其中它与从小分子到大型大分子复合物的结合伴侣相互作用。结合通过分子中的机械菌株调节，进而可以改变局部DNA结构。经常以封闭的拓扑形式发生DNA，拓扑和超串联为结合诱导的变形和应变调节结合的相互作用增加了全局约束。在这里，我们提出了一个定量模型，即DNA拓扑引入的全局约束如何调节结合并在拓扑和亲和力之间产生复杂的相互作用。我们专注于荧光介入量，该荧光介导剂放弃DNA并通过荧光检测启用直接定量。使用大量测量结果，我们表明，根据配体浓度和初始拓扑结构，相对于开放拓扑的DNA超螺旋可以增加或减少插入。我们的模型定量地说明了使用psoralen用于紫外线诱导的DNA交联获得的观察结果，该交联经常用于量化体内超螺旋。最后，我们观察到单分子测定中拓扑依赖性的结合，该结合可直接访问结合动力学和DNA超级旋转动力学。我们的结果对DNA的检测和定量以及在细胞环境中DNA结合的调节具有广泛的意义。
依赖拓扑的DNA结合
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