gentry 1,2, *,李陈3, *和拉蒙·C·太阳1,2, * 1 1佛罗里达州佛罗里达州盖恩斯维尔大学医学院生物化学与分子生物学系,美国佛罗里达州盖恩斯维尔大学2佛罗里达大学神经科学系,美国佛罗里达州盖恩斯维尔大学5成瘾研究与教育中心,佛罗里达大学,佛罗里达州盖恩斯维尔,佛罗里达州盖恩斯维尔6麦克奈特脑研究所,佛罗里达大学,佛罗里达州盖恩斯维尔大学,佛罗里达州7 7美国佛罗里达州盖恩斯维尔市9佛罗里达大学化学系,美国佛罗里达州盖恩斯维尔大学10年老化学院,佛罗里达大学,佛罗里达州盖恩斯维尔,美国#这些作者同等贡献:Harrison A. Clarke; Xin MA; Cameron J. Shedlock *这些作者共同监督这项工作:Matthew S. Gentry;李陈拉蒙·C·太阳摘要:代谢产物,脂质和聚糖是参与复杂生物系统的基本生物分子。它们通过定义生物体的生理学和病理学的无数途径和分子过程进行代谢引导。在这里,我们提出了一种蓝图,用于使用质谱成像从单个组织中对空间代谢组,脂肪组和糖的同时分析。个人赞美原始的实验协议,我们的工作流程包括一个称为空间增强多组学界面(SAMI)的计算框架,该框架提供了多组学的整合,高尺寸聚类,空间解剖学映射,具有匹配的多组学特征,以及为无效的互联网分配和互动的互动式分配,并提供匹配的多组学特征,并提供互动生物学。INTRODUCTION Metabolomics (Fiehn, 2002; Gibney et al., 2005; Lisec et al., 2006), lipidomics (Cajka and Fiehn, 2016; Han and Gross, 2005), and glycomics (Cummings and Pierce, 2014; Ruhaak et al., 2010; Wada et al., 2007) are three distinct facets of omics methodologies, each offering a unique window进入活生物体中相连且复杂的生化过程。这些领域的当前状态缺乏空间分辨率和统一的综合分析,这些分析提供了互连代谢景观的广泛概述。发展空间分辨的代谢组学,脂质组学和糖基因对于促进我们对生物系统的了解至关重要,并且有可能改变我们对复杂组织代谢异质性的理解,发现新型的生物标志物甚至治疗靶标。然而,这种综合方法的发展受到每个分子类别的理化特性和分析要求的固有差异的挑战。基质辅助激光解吸/电离(MALDI)质谱成像作为空间分辨分子分析的强大工具出现,提供了克服与合并样品分析相关的主要限制的可能性(Caprioli等,1997; McDonnell and Heeren,2007年)。
主要关键词