与使用单个向导 RNA (gRNA) 进行序列特异性引导 CRISPR/Cas9 结合和切割相反,Cas-CLOVER™ 系统使用双 gRNA 引导核酸酶,其中酶的每个半位点亚基都含有催化无活性的 Cas9 (dCas9) 和 IIS 型限制性内切酶 Clo51 的融合蛋白。与广泛用于 TALEN 和锌指核酸酶 (ZFN) 的 FokI 一样,Clo51 活性取决于二聚体的形成,因此 DNA 切割严格依赖于特定距离内两个不同的 gRNA 引导内切酶同时靶向结合。虽然当两个半位点 gRNA 共同递送至细胞时观察到酶的高切割效率,但当单独递送任一半位点 gRNA 时,在原代人类 T 细胞中未观察到靶向破坏。此外,直接比较T细胞中的野生型(WT)CRISPR/Cas9和Cas-CLOVER™表明,在同一基因位点,两种系统都能高效编辑基因组。