当前的基因组编辑工具使许多物种中选定的DNA序列的靶向诱变。但是,通过基因组编辑方法引入突变的效率和类型在很大程度上取决于目标位点。因此,很难预测编辑操作的结果。因此,量化突变频率的快速测定对于正确评估基因组编辑作用至关重要。我们开发了两种快速,具有成本效益且容易适用的方法:(1)潮汐,可以准确识别和量化插入和删除(indels),这些插入和删除(indels)在引入双链断裂后出现的(dsbs); (2)Tider,适用于模板介导的编辑事件,包括点突变。这两种方法仅需要一组PCR反应和标准的Sanger测序运行。通过潮汐或TIDE算法分析序列轨迹(可在https://tide.nki.nl或https://deskgen.com上获得)。例程很容易,快速,并且提供了比当前基于酶的测定更详细的信息。潮汐和TIDE加速基于DSB的基因组编辑策略的测试和设计。
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