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循环游离 DNA (cfDNA) 可揭示生理和病理状况，包括怀孕（Barrett 等人，2011 年）、癌症（Heitzer 等人，2015 年）、炎症（van der Meer 等人，2019 年）和移植排斥（Bloom 等人，2017 年；Thongprayoon 等人，2020 年）等。同时，由于 cfDNA 浓度低且易受分析前阶段不一致的影响，包括受损血细胞中的高分子量 (HMW) DNA 的人工污染，从而掩盖天然 cfDNA 特征（Bartak 等人，2019 年；Meddeb 等人，2019 年；van der Pol 等人，2022 年），因此 cfDNA 分析在技术上具有挑战性。具体而言，游离 DNA 片段的长度和端点分布似乎与来源细胞中的染色质结构有关，从而将 cfDNA 碎片特征与基因组的功能状态联系起来。高通量测序广泛研究了这一现象，提供了一种通用的方法框架（Ivanov 等人，2015 年；Snyder 等人，2016 年；Cristiano 等人，2019 年；Lo 等人，2021 年）。同时，基于 PCR 的方法在某些 cfDNA 分析应用中仍然广泛使用且更具成本效益。它们中的大多数侧重于样品质量控制，并针对各种蛋白质编码基因（Devonshire 等人，2014 年；Fernando 等人，2018 年；Alcaide 等人，2020 年）或
应用基于 PCR 的方法评估细胞...
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