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深度突变扫描是一种研究各种研究问题（包括蛋白质功能和稳定性）的有效方法。在这里，我们使用高通量 CRISPR 基因组编辑对参与细胞包膜合成的三种必需大肠杆菌蛋白质（FabZ、LpxC 和 MurA）进行深度突变扫描，并研究突变在其原始基因组环境中的影响。我们使用超过 17,000 种蛋白质变体来研究蛋白质功能和单个氨基酸在支持生存力方面的重要性。此外，我们利用这些库来研究针对选定蛋白质的抗菌化合物的抗药性发展。在所研究的三种蛋白质中，MurA 似乎是更优越的抗菌靶标，因为它的突变灵活性低，这降低了获得同时保留 MurA 功能的抗药性突变的机会。此外，我们根据每种化合物的抗药性突变数量对抗 LpxC 先导化合物进行进一步开发排名。我们的结果表明，深度突变扫描研究可用于指导药物开发，我们希望这将有助于开发新型抗菌疗法。
对必需细菌蛋白的深度突变扫描可以指导抗生素的开发
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