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背景：结核分枝杆菌的表型药物敏感性测试 (pDST) 可能需要长达 8 周的时间，而常规分子检测只能识别有限的一组耐药突变。靶向下一代测序 (tNGS) 可快速预测全面耐药性，本研究旨在探索其在印度孟买公共卫生实验室内的操作可行性。方法：通过常规方法和 tNGS 对同意的 Xpert MTB 检测阳性患者肺部样本进行耐药性检测。研究团队成员的实验室运营和后勤实施经验如下。结果：在接受检测的所有患者中，70% (113/161) 没有既往结核病史或治疗史；然而，88.2%（n = 142）患有利福平耐药/耐多药结核病（RR/MDR-TB）。对于大多数药物，tNGS 和 pDST 的耐药性预测之间具有高度一致性，总体而言，tNGS 识别耐药性的准确性更高。tNGS 被整合并融入实验室工作流程；然而，分批样本导致结果周转时间显著延长，最快为 24 天。手动 DNA 提取会导致效率低下；因此进行了协议优化。需要技术专业知识来分析未知突变和解释报告模板。tNGS 每个样本的成本为 230 美元，而 pDST 为 119 美元。结论：在参考实验室中实施 tNGS 是可行的。它可以快速识别耐药性，应被视为 pDST 的潜在替代方案。
公共卫生行动
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