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对于一些合成化学家来说,在有机化学和酶化学界面处挖掘优势是一项挑战。化学酶合成规划工具可以有效地帮助识别小分子制造中的生物催化机会。计算机辅助合成规划 (CASP) 中的逆合成技术通过从目标开始并递归选择适当的断开连接,提出了从可用起始材料到目标的可行多步合成路线。从 50 多年前提出的有机化学早期 CASP 工具开始,7,8 这些方法已经得到改进,可以使用基于规则的方法和机器学习来概括已知反应,从而预测达到所需目标的实际有机合成路线。9 – 11 酶逆合成的最新发展显示出为酶开发类似的 CASP 工具的巨大潜力。12 – 15 Finnigan 等人最近整理了一小组经过专业编码的反应规则来描述用于生物催化的酶工具箱。 13 这些反应规则隐含地反映了不同酶类已确定的底物混杂性。这些规则所代表的酶已被证明在许多情况下适合酶工程,以接受新的底物。13 此外,它们还被成功地用于规划针对目标分子的生物催化级联。尽管 RetroBioCat 成功地规划了多步酶促途径,但它无法提出针对所需目标的化学酶促途径,该途径协同涉及有机和酶促方法。

使用化学合成规划器进行计算机辅助多步化学酶逆合成

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