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人类的肠道微生物组由一个高度多样化的物种的财团组成，它们在宿主内外不断发展。识别许多3个人类肠道微生物的适应性的能力不仅会揭示宿主之间的共同选择压力，而且还会揭示可能影响社区结构和宿主5个特征的微生物组功能分化的关键驱动力。然而，迄今为止，还没有系统的扫描，这些适应已经散布在6个人类肠道微生物中。在这里，我们开发了一个新的选择扫描统计量，称为Integrated 7链接不平衡评分（ILDS），该评分（ILDS）可以通过迁移和水平基因转移来检测自适应单倍型在宿主8微生物中的扩散。具体来说，ILD利用了具有有益变体的有害变体的9搭便车的信号。将统计数据应用于10个中最普遍的共生肠道物种中的30种，来自世界24个人群，揭示了跨物种的11300多种选择性扫描。我们发现，在12个碳水化合物代谢的基因座中有选择性扫描的富集 - 潜在地表明适应宿主饮食的特征 - 我们发现13位选择的靶标在西方化和非媒介物popula-14 tions之间显着差异。强调了饮食在驾驶选择中的潜在作用，我们发现在非西方人群中没有选择性扫描15，但在西方人种群中无处不在，在一个已知的16个基因座中，与Maltodextrin的代谢有关，这是一种合成淀粉的代谢，最近已成为西方饮食的17种广泛范围。20总而言之，我们证明了跨18个宿主微生物组的选择性扫描是人类肠道微生物组进化的常见特征，并且19个选择靶标可能会受到宿主饮食的强烈影响。
遍布人类肠道微生物
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