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图2:ESM2预测结构化和无序残基的适应性景观。(a)呈现了人类HP1α蛋白(Uniprot ID:P45973)中氨基酸的ESM2评分,残基的PLDDT得分低于70,以蓝色突出显示,以表示缺乏确定结构的区域。(b)在结构秩序不同程度的三个区域的健身景观的详细观点。在左侧,人类HP1α蛋白的Alphafold2预测的结构以卡通表示显示,其颜色为PLDDT分数。三个特定区域,代表柔性无序(残基75-85),保守无序(残基87-92)和折叠(残基120-130)段,分别用蓝色,橙色和红色突出显示,使用球形粘贴样式。右侧的面板描绘了每个区域中每个区域的ESM2 LLR预测。(c,d)PLDDT和ESM2分布分布的直方图(C)和无序(D)残基。轮廓线表示计算为 - log P(PLDDT,ESM2)的自由能水平,其中P是基于其PLDDT和ESM2分数的残基的概率密度。轮廓以0.5个单位间隔间隔,以区分不同密度的区域。

蛋白质语言模型识别无序的,保守的基序驱动阶段分离

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