抽象的正叶病毒是节肢动物传播的单链RNA病毒,导致人类轻度至严重疾病,每年影响数百万的人,目前没有抗病毒药。该病毒属包括诸如tick传播脑炎病毒(TBEV),西尼罗河病毒(WNV)和Zika病毒(ZIKV)等病毒。正常非洲病毒具有自己的病毒蛋白,但是与其他病毒一样,它们也招募并利用几种细胞蛋白来实现其生命周期。尽管已经确定或表征了其中一些宿主因素,但其中大多数仍然不知道。在本文中,我使用了不同的工具来识别和表征与正常非病毒感染有关的新型蛋白质。了解细胞蛋白在病毒生命周期中的功能对于理解病毒的疾病机制和开发针对这些病毒的抗病毒药物很重要。在第一部分中,我们实施了蛋白质组学噬菌体显示(PROP -PD),以识别病毒和细胞蛋白之间的短线性基序(Slim)相互作用,并且该方法鉴定出多腺苷酸 - 结合蛋白1(PABP1)是许多RNA病毒的促病毒因子。在本文的第二部分中,我们通过执行抗坏血酸酯过氧化物酶(APEX)2屏幕来鉴定在TBEV NS4B附近发现的蛋白质,从而鉴定了参与TBEV感染的蛋白质。使用这种方法,我们确定了包含3(ACBD3)的酰基-COA结合域。通过修改内质网(ER)和Golgi之间的贩运,在TBEV和Langat病毒(LGTV)感染中影响病毒复制和组装的TBEV NS4B紧邻近距离发现。在论文的第三部分中,我们探讨了核孔蛋白(NUPS)在正叶病毒感染中的作用。nups是核孔复合物的基础,它是负责RNA和蛋白质在细胞核和细胞质之间运输的复合物。通过实施各种不同的分子生物学技术,我们确定NUP153和NUP98在病毒生命周期中至关重要。我们观察到,在正叶病毒感染期间,NUP153和NUP98在核中上调并从核区域募集到结合病毒RNA(VRNA)的胞质区域。我们发现NUP153调节病毒翻译,而NUP98对于病毒复制很重要,显示了该蛋白质家族在正佛病毒感染中的重要性和不同功能。此外,在本论文中,我们还评估了肽的使用来阻止这些特定的病毒宿主蛋白相互作用作为潜在的抗病毒药。我们表明,针对PABP1和NUP98的肽靶向和结合对几个正叶韦病毒是抗病毒活性的。在一起,本文中提出的发现使人们对病毒生命周期所需的特定宿主因素有了更好的了解。这些知识可用于新抗病毒药的发展。
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