在中央轴周围是反平行扭曲的两个多核苷酸链,形成右手双螺旋,沿顺时针方向向下旋转。这两个链通过氮碱的配对将其连接在一起。嘌呤碱(A&G)与嘧啶(T&C)碱基对。腺嘌呤对胸腺嘧啶和细胞氨酸对鸟嘌呤。 在A&T之间存在两个氢键,而C&G之间存在三个氢键。一个链中的腺嘌呤碱基数等于另一链中的胸腺胺碱数量,一个链中的细胞质碱基数等于另一链中的鸟嘌呤碱基数量。腺嘌呤对胸腺嘧啶和细胞氨酸对鸟嘌呤。在A&T之间存在两个氢键,而C&G之间存在三个氢键。一个链中的腺嘌呤碱基数等于另一链中的胸腺胺碱数量,一个链中的细胞质碱基数等于另一链中的鸟嘌呤碱基数量。