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肠道菌群在太空飞行条件下的肠道微生物在益生菌甚至益生元的食品营销等健康益处方面已在公共媒体中普及。在更深入的科学文献中，微生物群在太空飞行的讨论中很好地表示，但是特定的宿主相互作用较少。这项研究提出了宏基因组分析，表明对宿主健康至关重要的关键细菌种群变化，即短链脂肪酸（SCFA）和胆汁酸代谢。例如，用作胆汁酸代谢剂（例如Expibacter muris和dysosmobacter welbionis）的微生物富含丁酸酯的生产者，例如丁酸酯丁酸丁酸胰蛋白酶，耗尽。这些破坏与宿主代谢不规则有关，包括脂质积累和葡萄糖代谢受损。
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