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简介:miRNA靶基因的预测和鉴定对于理解mir NAS的生物学至关重要。报告的长期编码RNA(LNCRNA),MicroRNA 195-497簇宿主基因(MIR497HG)调节是由多个非编码RNA(NCRNA)(例如microRNAS(miRNA))介导的。miR497Hg在各种癌症中被认为是肿瘤抑制剂。然而,miR497Hg及其衍生的miRNA的影响在很大程度上是未知的,仍然需要进一步探索。采用实验方法通常很具有挑战性,因为某些LNCRNA难以通过当前的隔离技术识别和隔离。因此,引入了生物信息学工具以帮助这些问题。这项研究试图搜索和识别针对MiR497Hg的3'untranslated区域(3'UTR)的miRNA。方法:在这里,采用了生物信息学工具来识别潜在针对miR497hg的3'UTR的独特miRNA列表。结果:使用MIRDB提取了靶向MiR497Hg的3'UTR的57个候选miRNA。同时,Starmir预测了291个miRNA,可能针对MiR497Hg的3'UTR。使用Venny 2.1.0获得了36个miRNA的共同列表,并使用Starmir的LogitProb评分进一步缩小。最后,确定了总共4个miRNA(HSA-MIR-3182,HSA-MIR-7156-5P,HSA-MIR-452-3P和HSA-MIR-2117)。通过Targetscan鉴定出鉴定的miRNA的mRNA靶标。最后,使用富集进行了基因和基因组(KEGG)富集分析的基因本体论(GO)和京都百科全书(KEGG)富集分析。结论:这一发现可能有助于理解miR497Hg及其调节性miRNA之间的复杂相互作用。此外,在本研究中还提供了计算miRNA-target预测的比较分析,可能会为miRNA用于癌症研究中的生物标志物的基础。马来西亚医学与健康科学杂志(2024)20(1):161-167。 doi:10.47836/mjmhs.20.1.21马来西亚医学与健康科学杂志(2024)20(1):161-167。 doi:10.47836/mjmhs.20.1.21

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