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全球范围内爆发的 COVID-19 疫情在多个方面带来了前所未有的全球性挑战。大多数疫苗和药物开发都集中在刺突蛋白、病毒 RNA 聚合酶和病毒复制的主要蛋白酶上。利用生物信息学和结构建模方法，我们模拟了新型 SARS-CoV-2 包膜 (E) 蛋白的结构。该病毒的 E 蛋白与 SARS-CoV-1 的 E 蛋白具有序列相似性，并且在 N 端区域高度保守。顺便说一句，与刺突蛋白相比，E 蛋白在分离序列之间表现出较低的差异和可变性。使用同源性建模，我们发现最有利的结构可以作为传导 H + 离子的门控离子通道。结合口袋估计和与水对接，我们确定 N 端区域的 GLU 8 和 ASN 15 非常接近以形成 H 键，这通过将 E 蛋白插入 ERGIC 模拟膜得到进一步验证。此外，可以看到两个不同的“核心”结构，即疏水核心和中央核心，它们可能调节通道的开启/关闭。我们认为这是病毒离子通道活性的一种机制，在病毒感染和发病机制中起着关键作用。此外，它为疫苗开发和产生针对病毒的治疗干预措施提供了结构基础和额外途径。
新型 SARS-CoV-2 E 蛋白的结构解析
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