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我们表明,从细菌菌落开始,在一次 Illumina NextSeq 2000 运行中可以对数千个质粒进行测序,并在第二天完成生物信息学分析。我们利用可扩展的模块化流程,包括菌落挑选、液体处理、DNA 测序和生物信息学分析。滚环扩增 (RCA) 或菌落直接 PCR 取代了传统的细菌培养和质粒纯化。集成自动标准化、一步式文库制备技术可在方便的 384 孔、可立即测定的配置(384 孔 x 16 板)中提供 6,144 个索引。我们与其他工作流程的基准比较表明,这种自动化流程将典型的合成生物学 DBTL 周期从几周缩短到几小时。

合成生物学的超高通量测序...

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