DNA和核小体的联想记忆模型
机构名称:
¥ 1.0

引入了DNA和核小体的模型,目的是研究从单个碱基水平一直到高阶染色质结构的染色体。该模型被称为广泛可编辑的染色质模型(Wechrom),重现了双螺旋的复杂力学,包括其弯曲持久性长度和扭曲持久长度以及前者的温度依赖性。Wechrom Hamiltonian由链连接性,空间相互作用和相关记忆项组成,这些记忆项代表了所有剩余的相互作用,从而导致B-DNA的结构,动力学和机械性特征。讨论了该模型的几种应用,以证明其适用性。Wechrom用于研究圆形DNA在正和阴性超串联的主体中的行为。我们表明,它概括了底膜的形成和放松机械应力的结构缺陷。模型自发地表现出相对于正或负超串联的不对称行为,类似于实验中先前观察到的不对称行为。此外,我们表明,辅助记忆哈密顿量也能够再现核小体脱离部分DNA的自由能。Wechrom旨在模拟10nm纤维的连续可变机械性能,并且凭借其简单性,可以将其扩展到足以研究基因结构组合的分子系统。Wechrom在OpenMM仿真工具包中实现,可以免费使用。

DNA和核小体的联想记忆模型

DNA和核小体的联想记忆模型PDF文件第1页

DNA和核小体的联想记忆模型PDF文件第2页

DNA和核小体的联想记忆模型PDF文件第3页

DNA和核小体的联想记忆模型PDF文件第4页

DNA和核小体的联想记忆模型PDF文件第5页

相关文件推荐

DNA测序
2025 年
¥1.0
实时 DNA 测序
2024 年
¥2.0
DNA 测序
2025 年
¥7.0
DNA测序
2023 年
¥4.0
DNA钠
2019 年
¥1.0
DNA 测序
2020 年
¥1.0
DNA测序:
2024 年
¥1.0
DNA结果
2023 年
¥3.0
猪模型
2024 年
¥1.0
并发DNA和RNA测序1
2024 年
¥1.0
DNA分析
2023 年
¥2.0
DNA数据存储
2024 年
¥1.0
DNA结构
2023 年
¥1.0
经济模型
2022 年
¥1.0
DNA复制
2020 年
¥3.0
DNA数据存储
2023 年
¥1.0
的新模型的新模型
2024 年
¥5.0
DNA隔离
2023 年
¥1.0
DNA四链体
2003 年
¥1.0
DNA建筑
2020 年
¥1.0
DNA测序方法 div>
2023 年
¥2.0
DNA 政策
2023 年
¥1.0
肠上皮体外模型
2025 年
¥1.0
使用DNA
2003 年
¥1.0