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微生物，植物和动物之间的相互作用是自然而恒定的。由于人类粮食供应基本上是由植物，动物或产品源自它们的组成，因此可以理解的是，我们的食物供应可以包含与食物相互作用的微生物。在大多数情况下，微生物使用我们的食物供应作为自身生长的营养来源。这可能导致食物恶化。微生物可以通过增加养分，产生酶变化并促进非燃料的养分来“涂抹”食物。微生物分解食品或在食物变质过程中合成新化合物。这是他们自然界中的功能之一，是将死亡动植物和动物中碳，氮和硫的还原形式转化为氧化形式。
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